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生物學(xué)祖孫關(guān)系鑒定規(guī)范

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  • 2020-12-08 18:23:17
  • 文章來(lái)源:科鑒基因
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生物學(xué)祖孫關(guān)系鑒定規(guī)范-SF/Z JD0105005-2015(2015年11月20日發(fā)布實(shí)施)

1 范圍
本技術(shù)規(guī)范規(guī)定了法庭科學(xué) DNA實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行生物學(xué)祖孫關(guān)系鑒定的內(nèi)容及結(jié)果判斷標(biāo)準(zhǔn)。
本技術(shù)規(guī)范適用于在生母參與情形下鑒定祖父母與孩子的祖孫關(guān)系,其他情形的祖孫關(guān)系鑒定,本技術(shù)規(guī)范不適用。 
 
2 規(guī)范性引用文件
下列文件對(duì)于本技術(shù)規(guī)范的應(yīng)用是不可少的。凡是標(biāo)注日期的引用文件,僅標(biāo)注日期的版本適用于本技術(shù)規(guī)范。凡是不標(biāo)注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改單)適用于本技術(shù)規(guī)范。 
GA/T382-2014 法庭科學(xué)DNA實(shí)驗(yàn)室規(guī)范 
GA/T383-2014 法庭科學(xué) DNA實(shí)驗(yàn)室檢驗(yàn)規(guī)范 
GA/T965 法庭科學(xué)DNA親子鑒定規(guī)范 
SF/Z JD0105001 親權(quán)鑒定技術(shù)規(guī)范
司發(fā)通 [2007]71號(hào)司法鑒定文書(shū)規(guī)范 

3 術(shù)語(yǔ)和定義  下列術(shù)語(yǔ)和定義適用于本技術(shù)規(guī)范。 
3.1祖孫關(guān)系鑒定 Kinship Analysis of Grandparent(s) and Grandchildren
祖孫關(guān)系鑒定是通過(guò)對(duì)人類(lèi)遺傳標(biāo)記的檢測(cè),根據(jù)遺傳規(guī)律分析,對(duì)有爭(zhēng)議的祖父母與被檢孩子之間是否存在生物學(xué)祖孫關(guān)系進(jìn)行鑒定。依據(jù)參照親緣個(gè)體的多少,祖孫關(guān)系鑒定至少包括以下幾種情形:生母、祖父、祖母同時(shí)參與下被檢孩子與祖父、祖母間的祖孫關(guān)系鑒定;生母、祖父(或祖母)參與情形下被檢孩子與祖父(或祖母)間的祖孫關(guān)系鑒定;祖父、祖母同時(shí)參與情形下被檢孩子與祖父、祖母間的祖孫關(guān)系鑒定;祖父(或祖母)與被檢孩子間的祖孫關(guān)系鑒定。本規(guī)范中的祖孫關(guān)系鑒定特指生母、祖父、祖母同時(shí)參與鑒定下被檢孩子與祖父、祖母間的祖孫關(guān)系鑒定,該對(duì)爭(zhēng)議祖父母,要么雙方都與孩子存在祖孫關(guān)系,要么都不是孩子的祖父或者祖母。 
3.2平均非祖父母排除率 Mean Powerof Random Grandparents Excluded,RGE
是指通過(guò)檢測(cè)一個(gè)或多個(gè)遺傳標(biāo)記能將群體中隨機(jī)一對(duì)夫婦排除為孩子祖父母的能力。 
3.3祖孫關(guān)系指數(shù) Grandparent index, GI
祖孫關(guān)系指數(shù)為親權(quán)指數(shù)的一種,是生物學(xué)祖孫關(guān)系鑒定中判斷遺傳證據(jù)強(qiáng)度的指標(biāo)。是指爭(zhēng)議祖父母與孫子(女)之間存在祖孫關(guān)系時(shí)其遺傳表型出現(xiàn)的機(jī)率與爭(zhēng)議祖父母與孫子(女)為無(wú)關(guān)個(gè)體時(shí)其遺傳表型出現(xiàn)的機(jī)率之比值。 
 
4 相關(guān)參數(shù)計(jì)算方法
4.1共顯性遺傳標(biāo)記平均非祖父母排除率(生母參與情形下)的計(jì)算
 
式中: RGE—p1、p2、…、pn —為有 n個(gè)等位基因共顯性遺傳標(biāo)記系統(tǒng)的等位基因頻率。 
4.2祖孫關(guān)系指數(shù)的計(jì)算
在計(jì)算某一 STR基因座上的祖孫關(guān)系指數(shù)時(shí),首先應(yīng)依據(jù)遺傳學(xué)原理,參照被檢孩子及其生母的基因型,推斷出被檢孩子在該基因座上的生父基因。
當(dāng)被檢孩子與生母基因型相同(此時(shí)無(wú)法確定孩子生父基因)時(shí),則被檢孩子的兩種等位基因均有生父基因的可能。
當(dāng)被檢孩子與生母在該基因座不吻合遺傳規(guī)律、考慮存在生母等位基因突變的情形時(shí),首先應(yīng)考慮生母最可能的突變基因,進(jìn)而確定生父基因,如生母基因型為(7/8),被檢孩子為( 
9/10),則應(yīng)確定等位基因 10為生父基因,若生母基因型為( 8/8)或( 7/8),被檢孩子為( 9/9),則應(yīng)按生父基因?yàn)榈任换?9處理。若生母基因型為( 9/9)或( 6/9),被檢孩子為( 
8/10),則應(yīng)按生父基因?yàn)榈任换虿荒艽_定處理(即 8和10均有可能為生父基因)。通常不考慮被檢孩子生母基因與生父基因同時(shí)突變的可能。
當(dāng)生母與被檢孩子間不吻合遺傳規(guī)律的基因座個(gè)數(shù)超過(guò) 1個(gè)時(shí),則建議依據(jù)《 SF/Z JD0105001親權(quán)鑒定技術(shù)規(guī)范》先確認(rèn)生母與被檢孩子間的生物學(xué)母子關(guān)系。
在確定生父基因后,建議采用本地區(qū)的等位基因頻率,依據(jù) 4.2.1或4.2.2中給出的方法計(jì)算出每一個(gè)基因座相應(yīng)的祖孫關(guān)系指數(shù),并按 
4.3中的方法依據(jù)乘法規(guī)則要求基因座間連鎖平衡計(jì)算得到累積祖孫關(guān)系指數(shù)。 
4.2.1無(wú)突變情形下祖孫關(guān)系指數(shù)的計(jì)算
此處的無(wú)突變情形是指被檢孩子的生父基因與被檢祖父、祖母間吻合遺傳規(guī)律,不考慮突變的可能。
在無(wú)突變情形下,依據(jù)《 SF/Z JD0105001親權(quán)鑒定技術(shù)規(guī)范》 3.7中的親權(quán)指數(shù)的通用計(jì)算公式,祖孫關(guān)系指數(shù)的計(jì)算方法可簡(jiǎn)言為:被檢孩子生父等位基因來(lái)自于被檢祖父、祖母的概率與生父等位基因的人群等位基因頻率的比值。當(dāng)被檢孩子的兩個(gè)等位基因均有生父等位基因可能時(shí),生父等位基因的人群等位基因頻率為這兩個(gè)等位基因的人群頻率之和。
表1舉例說(shuō)明了無(wú)突變情形下不同基因型組合時(shí)祖孫關(guān)系指數(shù)的計(jì)算方法。 
4.2.2突變情形下祖孫關(guān)系指數(shù)的計(jì)算
此處的突變情形是指被檢孩子的生父基因與被檢祖父、祖母間不吻合遺傳規(guī)律,考慮突變的可能。
設(shè)男性 STR基因座的平均一步突變率為 μ,則女性 STR基因座的平均一步突變率為 μ/3.5,由于這一平均突變率既包含了步數(shù)增加的突變概率,又包含了步數(shù)減少的突變概率,而對(duì)于特定的基因型組合而言,其突變方向只能有一種,因此在進(jìn)行突變情形下的祖孫關(guān)系指數(shù)計(jì)算時(shí),男性和女性的突變率分別按0.5μ和μ/7計(jì)算。
若考慮被檢孩子可能的生父基因與被檢祖父或祖母間存在一步突變的可能,則在 4.2.1中所給出的祖孫關(guān)系指數(shù)計(jì)算方法中,分母依然為所有生父基因的人群概率(或之和),分子為每一生父基因的突變來(lái)源概率與相應(yīng)突變概率之積的總和,其中突變來(lái)源概率為相應(yīng)的突變來(lái)源數(shù)占祖父母所能提供的等位基因個(gè)數(shù)之比。 
舉例說(shuō)明如下:設(shè)生母基因型為 12/14,被檢孩子為基因?yàn)?12/14,祖父基因型為 13/13,祖母基因型為13/15。在計(jì)算這一特定的基因型組合情形下的祖孫關(guān)系指數(shù)時(shí),由于生父基因不能確定,故分母為等位基因 12和等位基因 14的人群中概率之和。計(jì)算分子時(shí)應(yīng)考慮:( 1)當(dāng)生父基因?yàn)?12時(shí),其來(lái)源于祖父的突變來(lái)源概率為 2/4=0.5,相應(yīng)的突變概率為 0.5μ;其來(lái)源于祖母的突變來(lái)源概率為 1/4=0.25,相應(yīng)的突變概率為 μ/7;( 2)當(dāng)生父基因?yàn)?14時(shí),其來(lái)源于祖父的突變來(lái)源概率為 2/4=0.5,相應(yīng)的突變概率為 0.5μ;其來(lái)源于祖母的突變來(lái)源概率為 2/4=0.5,相應(yīng)的突變概率為 μ/7;因此,在這一特定基因型組合情形下,分子為: 0.5×0.5μ+0.25×μ/7+0.5×0.5μ+0.5×μ/7=0.5μ+0.75×μ/7。
當(dāng)生父基因不能確定時(shí),若一種生父基因存在突變可能,而另一種生父基因吻合遺傳規(guī)律時(shí),則在分子計(jì)算時(shí)兩種可能性均應(yīng)納入計(jì)算。表 2舉例說(shuō)明了突變情形下部分基因型組合時(shí)祖孫關(guān)系指數(shù)的計(jì)算方法。
4.3累積祖孫關(guān)系指數(shù)的計(jì)算方法 

式中: CGI—GI1 、 GIn—
 
5 檢驗(yàn)程序 
5.1 采樣要求采樣要求參照 SF/Z JD0105001中的要求。 
5.2 DNA提取和保存檢材的 DNA提取和保存見(jiàn) GA/T383-2014和SF/Z JD0105001。 
5.3 DNA定量分析按照中華人民共和國(guó)公共安全行業(yè)標(biāo)準(zhǔn) GA/T382-2014和GA/T383-2014的要求進(jìn)行。 
5.4 PCR擴(kuò)增與分型 
5.4.1基因座 
5.4.1.1在進(jìn)行生物學(xué)祖孫關(guān)系鑒定時(shí),目前親緣關(guān)系鑒定常用的 19個(gè)常染色體 STR基因座( vWA、 D21S11、D18S51、D5S818、D7S820、D13S317、D16S539、 
FGA、D8S1179、D3S1358、CSF1PO、TH01、 TPOX、PentaE、PentaD、D2S1338、D19S433、D12S391、D6S1043)為本規(guī)范推薦檢測(cè)的基因座。 
5.4.1.2鼓勵(lì)在上述19個(gè)STR基因座基礎(chǔ)上增加更多的、經(jīng)過(guò)驗(yàn)證的、與上述 19個(gè)STR基因座不存在連鎖和連鎖不平衡的其它常染色體 STR基因座,以提高檢測(cè)系統(tǒng)效能。 
5.4.1.3當(dāng)被檢孩子為男性時(shí),可考慮對(duì)爭(zhēng)議祖父與孩子補(bǔ)充檢驗(yàn) Y-STR基因座(如 DYS456、DYS389I、 DYS390、DYS389II、DYS458、DYS19、DYS385a/b、DYS393、DYS391、DYS439、DYS635、DYS392、YGATAH4、DYS437、DYS438、DYS448等);當(dāng)被檢孩子為女性時(shí),可考慮對(duì)爭(zhēng)議祖母與孩子補(bǔ)充檢驗(yàn) X-STR基因座(如 GATA172D05、HPRTB、DXS6789、DXS6795、DXS6803、DXS6809、DXS7132、DXS7133、 DXS7423、DXS8377、DXS8378、DXS9895、DXS9898、DXS10101、DXS10134、DXS10135、DXS10074等)。 
5.4.2PCR擴(kuò)增
建議選用商品化的試劑盒進(jìn)行 PCR擴(kuò)增,在常染色體 STR基因座分型中,至少應(yīng)該包含 5.4.1.1中所規(guī)定的 19個(gè)常用 STR基因座的分型結(jié)果。每批檢驗(yàn)均應(yīng)有陽(yáng)性對(duì)照樣本(已知濃度和基因型的對(duì)照品 DNA和/或以前檢驗(yàn)過(guò)的、已知基因型的樣本)以及不含人基因組 DNA的陰性對(duì)照樣本。 PCR擴(kuò)增體系與溫度循環(huán)參數(shù)均按試劑盒的操作說(shuō)明書(shū)進(jìn)行。 
5.4.3PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的檢測(cè)與結(jié)果判讀使用遺傳分析儀,對(duì) PCR產(chǎn)物進(jìn)行毛細(xì)管電泳分析,使用等位基因分型參照物 (Ladder)來(lái)對(duì)樣本分型,步驟方法按照儀器操作手冊(cè)。 
 
6 鑒定意見(jiàn) 
6.1鑒定意見(jiàn)是依據(jù) DNA分型結(jié)果,對(duì)被檢孩子與祖父母間否存在生物學(xué)祖孫關(guān)系作出的判斷。 
6.2實(shí)驗(yàn)使用的遺傳標(biāo)記平均非祖父母排除率應(yīng)不小于 0.9999。平均非祖父母排除率的計(jì)算見(jiàn) 4.1。 
6.3為了避免潛在突變影響,任何情況下都不能僅根據(jù)一個(gè)遺傳標(biāo)記不符合遺傳規(guī)律就作出排除意見(jiàn)。 
6.4任何情況下都不能為了獲得較高的祖孫關(guān)系指數(shù),將檢測(cè)到的不符合遺傳規(guī)律的遺傳標(biāo)記刪除。 
6.5在滿足 6.2~6.4的條件下,累積祖孫關(guān)系指數(shù)大于 10000時(shí),支持被檢測(cè)夫婦是孩子生物學(xué)祖父母的假設(shè)。 
6.6在滿足 6.2~6.4的條件下,累積祖孫關(guān)系指數(shù)小于 0.0001,支持被檢測(cè)夫婦不是孩子生物學(xué)祖父母的假設(shè)。 
6.7在不能滿足 6.5或 6.6的指標(biāo)時(shí),應(yīng)通過(guò)增加檢測(cè)的遺傳標(biāo)記來(lái)達(dá)到要求。否則,建議無(wú)法作出鑒定意見(jiàn)。 

7 鑒定文書(shū)
生物學(xué)祖孫關(guān)系鑒定文書(shū)的格式要求參照《司法鑒定文書(shū)規(guī)范》 (司發(fā)通 [2007]71號(hào))。 

8 特別說(shuō)明 
8.1本規(guī)范僅適用于生母、祖父、祖母同時(shí)參與情形下,祖父母與被檢孩子間的生物學(xué)祖孫關(guān)系鑒定,這一鑒定的檢驗(yàn)假設(shè)包括以下兩種相互對(duì)立的兩種假設(shè)關(guān)系:爭(zhēng)議的祖父母與被檢孩子為無(wú)關(guān)個(gè)體;爭(zhēng)議的祖父母與被檢孩子間存在生物學(xué)祖孫關(guān)系。若不能確定生母與被檢孩子間的生物學(xué)母子關(guān)系,則本規(guī)范不適用。 
8.2對(duì)于 3.1中定義的其它情形下的生物學(xué)祖孫關(guān)系鑒定,將依據(jù)后續(xù)的研究結(jié)果給出相應(yīng)的實(shí)施規(guī)范,這些后續(xù)補(bǔ)充的實(shí)施規(guī)范將作為本規(guī)范的附件使用或在新版本的規(guī)范中發(fā)布。 
8.3依據(jù)當(dāng)前對(duì)親子關(guān)系鑒定的研究結(jié)果,常染色體及性染色體 STR基因座在減數(shù)分裂過(guò)程中的平均突變率( μ)相似,μ=0.2%。由于 STR突變中一步突變占 90%以上,二步或更多步的突變所占的比例很少 (<10%),根據(jù)逐步突變模型,可以認(rèn)為 STR的平均一步突變率約為 0.2%,平均二步突變率約為 0.2% 0.1,不同步數(shù)的平均突變率見(jiàn)《 SF/Z JD0105001司法鑒定技術(shù)規(guī)范—親權(quán)鑒定技術(shù)規(guī)范》。在祖孫關(guān)系指數(shù)計(jì)算過(guò)程中,仍建議對(duì)祖孫間 STR基因座的平均一步突變率以 0.2%計(jì)算。雖然祖孫間經(jīng)過(guò)了兩次減數(shù)分裂,但兩次減數(shù)分裂均突變的可能性很小,不需分別考慮由祖父母到生父、生父到孩子兩次減數(shù)分裂過(guò)程中均突變的可能,可根據(jù)祖孫等位基因之間的步數(shù)判別突變的等位基因,步數(shù)最小者才考慮突變。祖母與孫子 /女間的平均一步突變率按 0.2%的 3.5分之一計(jì)算。一般也不考慮祖父和祖母同時(shí)突變的可能性。
8.4對(duì)于補(bǔ)充檢驗(yàn)的 Y-STR或 X-STR檢測(cè)結(jié)果,建議僅對(duì) Y或 X染色體特殊的遺傳規(guī)律進(jìn)行描述性分析,判斷是否符合同一父系(被檢孩子為男性時(shí))或是否符合祖母與孫女(被檢孩子為女性時(shí))的遺傳規(guī)律。不推薦僅依據(jù)補(bǔ)充檢驗(yàn)的Y-STR或 X-STR基因座檢測(cè)結(jié)果出具明確的生物學(xué)祖孫關(guān)系鑒定意見(jiàn),應(yīng)以常染色體 STR的結(jié)果作為出具鑒定意見(jiàn)的主要依據(jù)。

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